2022年—2025年，上海市财政科技支出年均增幅超过20%，基础研究投入总体增长85%；“十四五”时期，上海全社会研发经费支出相当于全市生产总值的比例提高到4.5%左右。

经费大幅增长的背后，是近年来上海科技创新生态的持续优化。中国科学技术发展战略研究院编制的《中国区域科技创新评价报告2025》显示，上海的综合科技创新水平在各省区市中排名第一。这份报告的评价指标不以存量规模为主，而是用结构化指标反映各地创新投入产出和组织效率，客观评价地区创新生态的赋能水平。

在科技活动产出方面，上海得分排名全国第一，创新产出水平和技术成果转化二级维度也均为第一。与上年相比，上海技术国际收入增长8.94%，占全国的34.22%，万元GDP技术国际收入增加2.07美元，保持在全国第一位；万人科技论文数、万人有效注册商标数、万人高价值发明专利拥有量、亿元GDP知识产权使用费出口额均保持全国第二位；技术市场输出技术成交额增长19.93%，万人输出技术成交额增加2891.97万元，位次上升至全国第二。

生物医药产业的BD（商务拓展）收入，是一类重要的技术国际收入。医药魔方的统计数据显示，2025年，中国创新药BD对外授权交易总金额达到1356.55亿美元，首付款70亿美元，交易总量为157笔。在交易数量上，上海位居榜首，占全国交易总量的1/3左右。

科技论文的质量和人均数量，上海也占有优势。2025年，上海科学家在《科学》《自然》《细胞》三大国际顶刊发表论文181篇，占全国的30.6%，较2024年增长14.6%。其中，上海科学家为第一作者或通讯作者的论文有109篇，占全国的24.1%，较2024年增长29.8%。

“值得注意的是，在科技创新投入这个指标上，上海排名全国第五，而在科技创新产出这个指标上排名第一，显示出上海科技创新组织的效率很高，支撑全链条创新的科技服务业发展快速，服务创新产出的生态优势明显。”上海市科学学研究所统计评价研究室主任张宓之说。